Diawali dari ide beberapa anggota Jemaat Depok Jaya mengenai pembukaan perkumpulan doa baru di daerah Beji dengan pertimbangan banyak-nya anggota Gereja yang berdomisili di Kecamatan Beji. Pada Sabat ke 2 (dua) tahun 2006 angenda pembukaan cabang disampaikan pada komite Jemaat Depok Jaya dengan agenda pembukaan Sekolah Sabat Cabang di daerah Beji . Berdasarkan pertimbangan aktifitas dan kemajuan yang dijalankan oleh Sekolah Sabat Cabang Beji cukup pesat, maka pada 9 Mei 2010 lahir lah Jemaat Eben Haezer Beji Depok sebagai Gereja Masehi Advent Hari Ketujuh yang ke 136 di Konferens DKI.